Es el instrumento que con sus notas acompaña los distintos momentos de la celebración litúrgica. Fue realizado en 1522 por el conocido maestro organero senés Giovanni  Piffero que junto al de la iglesia de la Santísima Anunciada es una de sus mejores obras. Al origen fue colocado en la parte izquierda de la nave en donde inicia el crucero y hoy en día se encuentra arriba del portón de la . . .