L’épisode suivant, la Crucifixion, a été peint en 1502 environ par Pietro Perugino. La toile, située sur le second autel de la nef, à droite, dépeint Jésus à l’heure de la mort. Au pied de la croix, outre les saintes femmes et saint Jean Baptiste, on peut discerner quelques saints augustiniens : Monique, la mère d’Augustin; Augustin, le saint patron de l’Ordre et Jérôme, père . . .