L’episodio seguente, la Crocifissione, è stato dipinto nel 1502 circa da Pietro Perugino. La tavola, collocata sul secondo altare della navata, a destra, ritrae Gesù nell’ora della morte. Ai piedi della croce, oltre alle pie donne e a San Giovanni Battista, si individuano anche alcuni Santi agostiniani: Monica, la madre di Agostino; Agostino, il Santo patrono dell’Ordine e  Girolamo, . . .